Na classe dos Mamíferos pode referir-se a existência da Doninha ou Comadrinha (Mustela nivalis) do Ouriço-cacheiro (Erinaceus europaeus) e do Coelho bravo
No campo da Ictiofauna que ocorre nas águas interiores das ilhas, apenas em algumas das lagoas e ribeiras das ilhas de São Miguel e das Flores existem espécies piscícolas com interesse para a pesca desportiva, nomeadamente as Trutas, Fario e Arco-íris (Salmo truta e Oncorhynchus mykiss), o Lúcio (Esox lucius), a Carpa (Cyprinus carpio), a Perca (Perca fluviatilis) o Sandre (Stizostedion lucioperca) e o Ruivo (Rutilus rutilus).