A ilha das Flores faz parte do chamado Grupo Ocidental juntamente com a ilha do Corvo. É constituída na sua maior parte por montanhas, grandes ravinas e gigantescas falésias. O ponto mais alto das Flores é o Morro Alto, com 914 metros de altitude.
O ilhéu de Monchique é o ponto mais ocidental de Portugal e da Europa (ainda que a ilha assente na placa continental norte-americana). É frequentemente considerada uma das mais belas ilhas do arquipélago.